El Consejo se estructura en base a la Asamblea de miembros como máximo órgano decisorio, en la que cada entidad miembro dispone de un voto, independientemente de su tamaño o de las personas que asistan. Se realizan dos asambleas anuales, una en cada semestre.

La asamblea elige el Órgano Rector, cuya función es la ejecución y seguimiento de los acuerdos de la asamblea. Sus miembros oscilan entre 8 y 12 (o, en su caso, uno por cada 5 entidades) y se eligen cada cuatro años con renovaciones parciales cada dos.

La asamblea y el órgano rector pueden acordar la constitución de grupos de trabajo temáticos, en los que pueden participar personas no necesariamente vinculadas a entidades del consejo. Tienen carácter interno y responden ante la asamblea.

En su momento, podrá haber un Consejo Asesor de personas expertas en la problemática alimentaria, que habrán de suscribir la Carta de Principios.

También contamos con una Secretaría Técnica formada por dos de las entidades del Órgano Rector, de forma rotatoria, con duración anual.

Las funciones del Consejo Alimentario Madrid Región son las siguientes:

1. Presentar peticiones y propuestas.

2. Asesorar sobre políticas, planes y actuaciones tanto a las administraciones como a otras organizaciones.

3. Valorar y pronunciarse sobre políticas públicas y anteproyectos de los reglamentos y ordenanzas.

4. Trabajar por el desarrollo de políticas públicas, planes y normas que favorezcan la creación y consolidación de estos sistemas alimentarios sostenibles.

5. Ser un espacio de difusión y divulgación.

6. Potenciar la cooperación y la coordinación con movimientos sociales, sindicatos, asociaciones vecinales, AFAs, etc.

7. Apoyar y amplificar el alcance e impacto de las entidades y redes que trabajan por la soberanía alimentaria y la agroecología.

8. Apoyar al sector productivo alineados con los principios del Consejo, para asegurar su viabilidad.

9. Mantener una comunicación fluida con otros Consejos Alimentarios de otros territorios.

10. Mantener una comunicación estable con otros Consejos sectoriales de la región.